MITx: 7.00x Introduction to Biology - The Secret of Life



https://courses.edx.org/courses/MITx/7.00x/2013_SOND/wiki/7.00x/lecture-links/

에서 mp4를 받을 수 있다.

week 별로 torrent 파일로 통째로 받을 수도 있다.


선생님이 결론만 얘기해주는 것이 아니라 이야기를 해주니까 너무 좋다.

L10 DNA


강의 내용이 좀 유전자 중심이다. 선생님이 자기 전공 중심으로 강의하시는 듯.

내용은 매우 알차다.



단어장

http://wordbook.daum.net/my/wordbook.do?id=9036461



진도


Lecture 1: Introduction to Biology


biology가 어디에 쓰이나

medicine, forensic, history, genetic engineering,

사람의 1/4는 네안데르탈인 DNA네.


Biosphere > Ecosystem > Organism > Organ > Tissues > Cells > Organelles > Molecules


biochemistry, genetics, molecular biology,

biological function, protein, gene,

의 관계. 마지막에 recombinent DNA가 역할을 했네.


Lecture 2: Biochemistry of Life


The death of vitalism

en(something) + zyme(yeast)


Non covalent bonds

  1. hydrogen bond

  2. ionic bond

  3. van der walls bond: polar도 아닌데 일시적으로 negative positive가 생기는 것. 예: gecko


Hydrophobic forces


hydro phobic, phillic: lipid bi-layer

negative를 3개 모아두면, 에너지를 저장할 수 있다. ATP


설명이 효과적이다.


Lecture 3: Proteins and Protein Structure


단백질부터 배우네.

아미노산은 amino - C - carboxyl 과 R이 합쳐진 것


secondary structure

  1. alpha helix

  2. beta sheet

  3. loops

조합으로 tertiary structure를 만든다.

quatenary structure: 또 조합. hemoglobin은 단백질 4개의 조합.


Lecture 5: Glycolysis


delta G > 0 ⇐⇒ A → B reaction is unfavorable

A + C → B + D 로 favorable reaction으로 바꿀 수도 있다.

ATP가 delta B << 0



Lecture 6: Mendel


MENDEL'S EXPERIMENTS


6.2

멘델이 그냥 나온 게 아니네. 유럽이 신대륙을 찾아서 새 품종을 많이 들여왔고, 이런 저런 breeding실험을 했다. spain의 wool이 좋았는데, 옛날 Moravia라는 나라의 fashion industry에서도 spainish 양을 들여와서 local에서 키우고 싶어했고, 과학자를 양성했다.



cytology가 발달했고, 세포 안에 뭔가 염색이 되는 것이 발견됐다. 이름 먼저 붙였다. colored body: chromosome

세포 분열 동영상을 보여주는데, 놀랍다. 처음 볼 땐 소름 돋았네.



Week 08

population genetics

혈우병처럼 우성 유전이면 2pq + q^2 = 2pq

cystic fibrosis처럼 열성 유전이면, 1/2000 가 발생할 때, q = root 1/200 = 1/44

근데, cystic fibrosis 자식이 있는 보인자 부모 family를 엄청 모아서 조사해 보면, 1/4가 아니라, 1/3이 나온다. 자식이 cystic fibrosis가 안나타나면, 계산에 포함되지 않아 버리기 때문에.


first cousin marrage에서 부모 중 1명이 보인자이면, 1/16로 gene이 전달된다.


Lecture 10: DNA as the Hereditary Material


DNA 구조


sugar + phosphate + …

+ base (A, C, T, G)


protein에는 sulfur가 있고, DNA에는 인이 있다.

두 atom의 isotope을 갖고 있는 bacteria phage

P가 bacteria로 들어가는 것을 알게 됐다.


Chargaff가 nA = nT, nG = nC를 알아냈다.

라이너스 폴린이 triple helix model을 만들었다.


왓슨 크릭 DNA pager가 양면 1 page밖에 안되네.


Lecture 11: Central Dogma: DNA Replication


DNA의 helix가 다른 helix를 복사하는지 알기 위해서

isotopes of N: 14N, 15N

두 개를 사용하는 방법이 있었네.


Arthur Kounberg

복사 화학 반응 mechanism을 이해하기. 실제 DNA replication보다는 매우 느리다.

3’ 쪽에 OH가 있다. pppGOH 같은 게 달라붙는다.


맨 처음 primer는 어떻게 붙나. primase enzyme

복사한 다음에 얽혀 있는 두 개를 분리해내는 것은 topoisomerase


Lecture 12: Central Dogma: Transcription and Translation



RNA Polymerase 에 의해서 transcription 시작?

proof reading이 없다. 에러가 1/10^4



Lecture 15: Cloning: Purifying a Gene


bacteria에 restriction enzyme이 있는데, virus로부터의 defence mechanism. 그래서 restriction.

자기 gene에는 잘림 methylase으로 방지를 해 놓는다.


plasmid에는 antibiotic resistant gene이 자주 있다.

bacteria가 죽으면, 동그란 gene이 그냥 드러난다. 다른 bacteria가 먹는다.

horizontal transform으로 antibiotic resistant bacteria가 엄청 생길 수 있네.



Lecture 16: Finding a Specific Gene in the Library


recombinant DNA를 만들 때, ligase가 bacteria DNA를 다시 붙여버리지 않도록, 5’에 P를 제거한다.



Lecture 17: Analyzing a Gene


3’의 OH까지 떼어내면, defective T같은 것을 만들어서, 임의의 길이의 DNA를 얻는다.


Lecture 18: Human Genome and Positional Cloning


human genome project 초기 방식설명.

1. Genetic mapping: 대충 어디 쯤인지 genetic marker와 교차율 계산해서 알아내기

2. Physical mapping: target을 좁혀 나간다. 겹치는 작은 영역을 중첩해가면서.



L19

mithocondria DNA를 조사하면, 세상의 모든 사람의 엄마를 추적할 수 있다.

네안데르탈인과는 섞이지 않았다.


Lecture 20: Observing



백혈병이 2가지가 있다. AML, ALL

이제는 tumor RNA로 금방 판단할 수 있다.



Lecture 21: Perturbing the Genome to Probe Function


double stranded RNA를 넣으면, mRNA를 제거할 수가 있다.

double stranded RNA virus에 대한 defence mechanism


VLDL

LDL =< low density lipoprotein = bad cholesterole

IDL

HDL = good cholesterole

chylomicrons


VLDL → IDL → LDL


LDL receptor가 문제였네.


막판에 토론도 재밌다. 선생님이 특허법 등에 대해서도 심도 있게 lead해 준다.

BRCA1 gene이 patent 인 것에 대해서.

US Supreme court 결정은 아직 안 난 상태였네. 2013년 06월에 결정 났네. 특허 취소.

http://ipleft.or.kr/?p=4866




by 언제나19 2014. 8. 15. 00:19



University of California, Irvine
Preparation for Introductory Biology: DNA to Organisms

를 신청하고 2주치 정도까지 잘 봤는데, 뒷부분 강의를 볼 수 없네.

돈을 내고 signature track에 등록해야 볼 수 있나보다.

처음 부분은 내용이 좋았는데, 아쉽다..


1달 쯤 전에 봤다.

by 언제나19 2013. 12. 12. 01:22




Introduction to Genetics and Evolution




Review

이름으로 봐서는 아랍계인 것 같지만, 미국식 영어.

씩씩한 말투. 매우 설득력이 있다. 집중도 잘 된다.

화면 배치도 좋다. gesture도 좋다.

관련 자료 링크도 많이 알려준다.


매우 좋아. 110점.



단어장

http://wordbook.daum.net/my/wordbook.do?id=8366647

Lectures and notes

진도.

Week 1




devout 독실한

atheist 무신론

lucid 명쾌한

sentiment 정서


Week 2 - 4 (S) Mitosis, Meiosis, and Ploidy (08:21)



ploidy 배수성

improbable 일어날 것 같지 않은


Week 3 - 4 (S) Genetic Mapping (11:39)

Week 3 - 6 (S) Mapping Traits Relative to Markers in a Population (21:53)




Week 4 - 3 (S) Mutation Rates (10:18)


한 세대에 평균 63번 돌연변이. - Island 연구

남자 나이가 많을 수록 돌연변이가 많다. 1살에 2개.


autism 자폐증

deleterious 해로운



Week 7 - 1 (S) Natural Selection Fundamentals (17:45)


Natural selection과 genetic drift가 evolution의 중요한 기작.




Week 8 - 1 (G) Evolutionary Advantages of Sex (10:36)


Week 8 - 5 (G, S) Signatures of Natural Selection in Individual Genes (15:55)

natural selection의 영향이 얼만큼인지 판단하는 지표 계산 방법이 2개가 있네.


Week 8 - 6 (S) Searching for Natural Selection: dN/dS (13:37)

Week 8 - 7 (S) Searching for Natural Selection: McDonald-Kreitman Test (15:25)


진정으로 얼마나 어떤 의미인지 깊게 생각해보지는 않았다.


Week 9 - 1 (G) Optimality and Adaptive Feeding (19:20)

animal behavior

미생물이 많은 지역에서 매운 양념을 많이 먹는다.

bee language 연구에 대한 link도 있다. robot bee도 있대, 헐.


Week 9 - 2 (G) Communication and Parental Care (18:29)

헝, 동물들 세계에는 잔인하고 재밌는 관계가 정말 많아. 그런데, 그걸 당연하게 생각하고 공부한다. human sense로 보지 말자고 한다.


Week 9 - 4 (S) Effects of Geography (14:55)

NOT selection for barrier effect specifically. 갑자기 이유도 없이 gene이 바뀌는 건 아니다.

오랜 궁금증이 하나 풀렸네.


Week 9 - 5 (S) Genetic Control (13:33)

hybrid는 왜 불임인가


Week 10 - 1 (G) Applications of Evolutionary Insights (16:40)

음질이 조금 안좋은 구간이 있다.

dengue vaccine이 아직 없나 보네. 그런데, 모기가 wolbachia bacteria 에 걸리면, dengue 위험이 줄어든다.


Week 10 - 2 (G) MISapplications of Evolutionary Insights (10:12)


eugenics 우생학















by 언제나19 2013. 10. 30. 00:48


May 1st (12 weeks long)

Useful Genetics

May 1stJul 24th



나이 많은 여자 선생님.


진도


3G 정도에서

우성, 열성 현상이 왜 나타날까 문득 생각이 났다. 배우는 보람이 있네.


미국에서는 졸리가 받은 brca1 유방암 유전자 테스트를 받으려면 한 회사에서밖에 안된다. 특허 때문에.


5g

haplotypes

차음 generation 몇 번은 급격하게 달라지지만 100만년 뒤에도 base pair 가 꽤 남아 있다


역시나

mitosis

miosis

부분이 제일 알차다


멘델 부분에서도 문제는 풀 만 하다


9

다운증후군

터너 클라인펠터 증후군

생각보다 많고 형질도 정상적이네.



quackery [|kwӕkəri]




by 언제나19 2013. 10. 30. 00:41



Biology Concepts: Cells to Evolution            Kelly Carrier        These videos are introductions to the following biology concepts:  Structure and Function of Cells, Reproduction of Cells, DNA, Proteins Synthesis, Ecology/Population Ecology and Evolution.    http://deimos3.apple.com/WebObjects/Core.woa/Feed/k12.mi.us-dz.4769327808.04769327810

매우 좋다. 고등학교 선생님이 가르친다. 고등학교 교과과정인가보다. 제일 먼저 보는 게 좋겠다.

tablet pen으로 써서 가르쳐주는 방식.

내용이 많지도 않아서 좋다.


Biology            Khan Academy        Covers topics seen in a first year college or high school biology course.    http://deimos3.apple.com/WebObjects/Core.woa/Feed/khanacademy.org-dz.4627310763.04627310765


짧은 시간에 핵심을 잘 가르쳐준다. 기작에 대해서는 상세하게 가르쳐준다.

tablet pen으로 써서 가르쳐주는 방식.

대화하듯이 설명해준다. 그림도 잘 그린다. 부분적으로 잘 모르는 부분에 대해서 다시 찾아보는 것도 좋겠다.



Biology 1B, 001|Spring 2012|UC Berkeley George RODERICK, Craig MORITZ, Lewis J FELDMAN, Mike MOSER BIOLOGY 1B LEC 001 Sp12 http://deimos3.apple.com/WebObjects/Core.woa/Feed/berkeley.edu-dz.12490139017.012490139019

처음은 organisms 부분.
담당 선생님이 활기차다. 목소리가 강력해서 집중이 매우 잘 된다. 수업 방식도 좋다.
식물은 별로 공부하고 싶지 않았는데도 자꾸 빠져든다. 식물 얘기가 너무 많이 나온다는 것이 조금 아쉽다.
두 번째는 유전 부분. 목소리가 너무 단조롭다. 소리도 잘 안 들린다. 약간 권위적이고 일반적인 강의.
네 번째는 생태학. 생태학은 선생님은 보통 정도로 좋은 것 같지만, 과목에 관심이 잘 안 간다.



Lecture 11
ethylen 을 통해 과일이 혼자서 익는 것에 대해서 배운다. 실생활에 도움이 된다.

2012 년 연말쯤에 다 봤다~ 다음에 식물 부분 선생님이 가르치는 부분만 다시 봐야지.



그 외 과목

BIOL 121: Anatomy & Physiology I            Robert Swatski        BIOL 121 is intended for students who contemplate careers in Allied Health fields. Topics include: basic body organization; functional biochemistry; cytology and histology; the study of the integumentary, skeletal, muscular, circulatory, lymphatic, and re    http://deimos3.apple.com/WebObjects/Core.woa/Feed/hacc.edu-dz.6614094738.06614094740

잘 가르쳐준다. 계속 듣다 보면 어려운 용어들도 기억에 남을 것 같다. 해부학 공부할 때 다시 봐야지.


BIOL 221: Microbiology - dw            Dave Wartell        BIOL 221 - A comprehensive study of the structure and function of microorganisms. Control of microorganisms, immunity, and microbes in the news are also presented. Selected infectious diseases are discussed; laboratory activities emphasize procedures and     http://deimos3.apple.com/WebObjects/Core.woa/Feed/hacc.edu-dz.6614094402.06614094404

이것도 걸으면서는 볼 만 하다. 쉬워서 좋다. 화질이 안좋은 것이 단점.


Virology            Columbia University        This introductory virology course emphasizes the common reactions that must be completed by all viruses for successful reproduction within a host cell and survival and spread within a host population. The molecular basis of alternative reproductive cycles    https://itunesu.itunes.apple.com/WebObjects/LZDirectory.woa/ra/directory/courses/508805930/feed

화질이 좋다.

presentation 화면만 보이기 때문에 어디를 설명하는지 알기 힘들 때가 있다.


by 언제나19 2013. 1. 31. 23:09
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