MITx: 7.00x Introduction to Biology - The Secret of Life

https://courses.edx.org/courses/MITx/7.00x/2013_SOND/wiki/7.00x/lecture-links/

에서 mp4를 받을 수 있다.

week 별로 torrent 파일로 통째로 받을 수도 있다.

선생님이 결론만 얘기해주는 것이 아니라 이야기를 해주니까 너무 좋다.

L10 DNA

등

강의 내용이 좀 유전자 중심이다. 선생님이 자기 전공 중심으로 강의하시는 듯.

내용은 매우 알차다.

진도

Lecture 1: Introduction to Biology

biology가 어디에 쓰이나

medicine, forensic, history, genetic engineering,

사람의 1/4는 네안데르탈인 DNA네.

Biosphere > Ecosystem > Organism > Organ > Tissues > Cells > Organelles > Molecules

biochemistry, genetics, molecular biology,

biological function, protein, gene,

의 관계. 마지막에 recombinent DNA가 역할을 했네.

Lecture 2: Biochemistry of Life

The death of vitalism

en(something) + zyme(yeast)

Non covalent bonds

1. hydrogen bond

2. ionic bond

3. van der walls bond: polar도 아닌데 일시적으로 negative positive가 생기는 것. 예: gecko

Hydrophobic forces

hydro phobic, phillic: lipid bi-layer

negative를 3개 모아두면, 에너지를 저장할 수 있다. ATP

설명이 효과적이다.

Lecture 3: Proteins and Protein Structure

단백질부터 배우네.

아미노산은 amino - C - carboxyl 과 R이 합쳐진 것

secondary structure

1. alpha helix

2. beta sheet

3. loops

조합으로 tertiary structure를 만든다.

quatenary structure: 또 조합. hemoglobin은 단백질 4개의 조합.

Lecture 5: Glycolysis

delta G > 0 ⇐⇒ A → B reaction is unfavorable

A + C → B + D 로 favorable reaction으로 바꿀 수도 있다.

ATP가 delta B << 0

Lecture 6: Mendel

MENDEL'S EXPERIMENTS

6.2

멘델이 그냥 나온 게 아니네. 유럽이 신대륙을 찾아서 새 품종을 많이 들여왔고, 이런 저런 breeding실험을 했다. spain의 wool이 좋았는데, 옛날 Moravia라는 나라의 fashion industry에서도 spainish 양을 들여와서 local에서 키우고 싶어했고, 과학자를 양성했다.

cytology가 발달했고, 세포 안에 뭔가 염색이 되는 것이 발견됐다. 이름 먼저 붙였다. colored body: chromosome

세포 분열 동영상을 보여주는데, 놀랍다. 처음 볼 땐 소름 돋았네.

Week 08

population genetics

혈우병처럼 우성 유전이면 2pq + q^2 = 2pq

cystic fibrosis처럼 열성 유전이면, 1/2000 가 발생할 때, q = root 1/200 = 1/44

근데, cystic fibrosis 자식이 있는 보인자 부모 family를 엄청 모아서 조사해 보면, 1/4가 아니라, 1/3이 나온다. 자식이 cystic fibrosis가 안나타나면, 계산에 포함되지 않아 버리기 때문에.

first cousin marrage에서 부모 중 1명이 보인자이면, 1/16로 gene이 전달된다.

Lecture 10: DNA as the Hereditary Material

DNA 구조

sugar + phosphate + …

+ base (A, C, T, G)

protein에는 sulfur가 있고, DNA에는 인이 있다.

두 atom의 isotope을 갖고 있는 bacteria phage

P가 bacteria로 들어가는 것을 알게 됐다.

Chargaff가 nA = nT, nG = nC를 알아냈다.

라이너스 폴린이 triple helix model을 만들었다.

왓슨 크릭 DNA pager가 양면 1 page밖에 안되네.

Lecture 11: Central Dogma: DNA Replication

DNA의 helix가 다른 helix를 복사하는지 알기 위해서

isotopes of N: 14N, 15N

두 개를 사용하는 방법이 있었네.

Arthur Kounberg

복사 화학 반응 mechanism을 이해하기. 실제 DNA replication보다는 매우 느리다.

3’ 쪽에 OH가 있다. pppGOH 같은 게 달라붙는다.

맨 처음 primer는 어떻게 붙나. primase enzyme

복사한 다음에 얽혀 있는 두 개를 분리해내는 것은 topoisomerase

Lecture 12: Central Dogma: Transcription and Translation

RNA Polymerase 에 의해서 transcription 시작?

proof reading이 없다. 에러가 1/10^4

Lecture 15: Cloning: Purifying a Gene

bacteria에 restriction enzyme이 있는데, virus로부터의 defence mechanism. 그래서 restriction.

자기 gene에는 잘림 methylase으로 방지를 해 놓는다.

plasmid에는 antibiotic resistant gene이 자주 있다.

bacteria가 죽으면, 동그란 gene이 그냥 드러난다. 다른 bacteria가 먹는다.

horizontal transform으로 antibiotic resistant bacteria가 엄청 생길 수 있네.

Lecture 16: Finding a Specific Gene in the Library

recombinant DNA를 만들 때, ligase가 bacteria DNA를 다시 붙여버리지 않도록, 5’에 P를 제거한다.

Lecture 17: Analyzing a Gene

3’의 OH까지 떼어내면, defective T같은 것을 만들어서, 임의의 길이의 DNA를 얻는다.

Lecture 18: Human Genome and Positional Cloning

human genome project 초기 방식설명.

1. Genetic mapping: 대충 어디 쯤인지 genetic marker와 교차율 계산해서 알아내기

2. Physical mapping: target을 좁혀 나간다. 겹치는 작은 영역을 중첩해가면서.

L19

mithocondria DNA를 조사하면, 세상의 모든 사람의 엄마를 추적할 수 있다.

네안데르탈인과는 섞이지 않았다.

Lecture 20: Observing

백혈병이 2가지가 있다. AML, ALL

이제는 tumor RNA로 금방 판단할 수 있다.

Lecture 21: Perturbing the Genome to Probe Function

double stranded RNA를 넣으면, mRNA를 제거할 수가 있다.

double stranded RNA virus에 대한 defence mechanism

VLDL

LDL =< low density lipoprotein = bad cholesterole

IDL

HDL = good cholesterole

chylomicrons

VLDL → IDL → LDL

LDL receptor가 문제였네.

막판에 토론도 재밌다. 선생님이 특허법 등에 대해서도 심도 있게 lead해 준다.

BRCA1 gene이 patent 인 것에 대해서.

US Supreme court 결정은 아직 안 난 상태였네. 2013년 06월에 결정 났네. 특허 취소.

http://ipleft.or.kr/?p=4866

나폴레옹이 왜 죽었을까

머리카락에서 비소가 검출돼서 독살 당했다고 생각했었는데, 그의 방 벽화에 이미 비소가 들어 있었고, 섬 곰팡이가 비소를 가스로 만들었다.

게다가, 나폴레옹은 위장암이 있었고, 당시 의사들은 수은 같은 것을 치료약으로 쓰고 있었다.

케네디가 죽을 때, 총을 쏜 사람은 한 사람인 것 같다.

당시에 발견된 탄환의 조각을 조합해 보면, 총알은 2개?였었던 듯.

Putrefaction

ABO blood type의 항원항체 반응

근데 왜 antibody가 들어있는지 모르겠네

D antigen은 +로 표시.

요새 왠만한 흔적은 다 드러나니까 발뺌하기가 힘들겠다.

오히려 false positive가 늘어나지 않았을까 걱정이 된다.

영화 어머니에서는 엄한 사람이 혈흔 때문에 잡혀가던데.